于是朱聿鐭暗中便将张肯唐等他信得过的重臣招至了他的宫中，密议对策，但是张肯唐这些人皆身为文官，手中并无多少兵可用，根本不能拿郑芝龙怎样，而张肯唐也怕郑芝龙一旦投降，会对他先下手，于是张肯唐等人便怂恿朱聿鐭放弃这个帝位，干脆逃往两广投靠永历朝，即便是皇帝当不成，起码可以保住性命。
于是朱聿鐭思前想后一番之后，觉得性命还是重要一些，更何况这种傀儡皇帝当的也不痛快，做不做这个皇帝对他来说都已经是无所谓了。
在上元节过后，朱聿鐭终于下定了决心，背着郑芝龙，暗中让张肯唐联络了一个叫方正明的都指挥佥事，并且笼络了千余名效忠于大明的明军旧部，突然间便护着朱聿鐭逃出了泉州府，一路朝着广东方向逃去。
什么皇帝不皇帝，朱聿鐭这会儿已经不在乎了，他只想着赶紧离开这个是非之地，有多远走多远，至于永历帝会如何安置他，这会儿他暂时已经顾不上了。
负责镇守泉州的大将正是郑芝龙的弟弟郑芝豹，郑芝豹怎么也没有想到，绍武帝居然会在这个时候选择逃离泉州，连皇帝的位子都不要了，所以起初有人禀告他，说都指挥佥事方正明带领千余明军旧部，离开泉州的时候，他还没怎么在意，只是派人去追上方正明，问其要做什么。
而方正明则回答，说奉旨前往漳州府，增援在漳州府以南的兵马，而这个时候绍武朝的军事方面并没有统一，虽说以郑芝龙的郑军实力最强，但是毕竟郑芝龙并未控制全部兵马，一些福建的明军并没有全部接受郑芝龙的统御，故此虽然郑芝豹有点怀疑方正明此行的目的，但是起初他以为最多方正明也就是看不惯他们郑家把持绍武朝的军权，想要离开这里罢了。
对于那千余名明军，郑芝豹也没想怎么样他们，他们走了正好，也省的他们郑家要出钱出饷来养活他们了。
但是随后郑芝豹才发现，事情没有他想的那么简单，方正明跑的时候，张肯唐也不见了踪影，接着宫中传出消息，说绍武帝也突然失踪了，郑芝豹这才意识到出大事了。
于是郑芝豹一边派人立即快马加鞭朝南追赶绍武帝一行人，一边赶紧派人给郑芝龙报信。
但是这个时候他动作已经慢了许多，绍武帝在张肯唐和方正明等人的护送下，已经远离了泉州府，快要进入到漳州府了。
郑芝龙听闻这个消息的时候，绍武帝已经跑了快一天时间了，所以郑芝龙惊得是目瞪口呆，一时间也有点麻了手脚了。
要知道现如今他郑芝龙之所以能名正言顺的控制福建，最重要的就是他曾经是大明福建总兵官，而绍武帝则是他立足的根本，绍武帝在，他便可以名正言顺的执掌兵马，但是现如今绍武帝突然之间，便弃了他而去，就等于是已经彻底于他决裂，他便不再是什么绍武朝兵马大将军了。